Afin d’analyser les vestiges bioarchéologiques (pollen, phytolithes, charbons…) et les résidus biomoléculaires (résines, lipides…), le plateau est doté de deux salles de préparation des échantillons, une salle de traitement thermique et d’une salle d’analyses archéochimiques.
La gestion, le traitement et la conservation des échantillons s’appuient sur une base de données.