Direction : Manon Vuillien et Antoine Pasqualini
Contact : manon.vuillien@univ-cotedazur.fr, antoine.pasqualini@cnrs.fr
Sujet de M1 2P2A pour la rentrée 2026-2027 (possibilité de poursuite en M2)
Comprendre les enjeux liés à l’érosion de la biodiversité nécessite une étude approfondie de la diversité animale en mobilisant des données archéozoologiques afin d’identifier et de caractériser les espèces et variétés disparues ou adaptées à des milieux anthropisés au cours de l’Holocène. Or, l’identification taxinomique des espèces morphologiquement proches, comme les caprinés et les cervidés, trouvées en contexte archéologique est un défi auquel sont confrontés régulièrement les archéozoologues. Traditionnellement, le processus d’identification d’un reste osseux ou dentaire repose sur des critères anatomiques, morphologiques et biométriques. Les taxons archéologiques sont confrontés à leurs homologues modernes ou fossiles documentés dans des ostéothèques ou représentés dans les atlas d’anatomie. Cependant, cet exercice peut s’avérer difficile en raison de la mauvaise conservation, de la fragmentation et des convergences morphologiques au sein d’espèces étroitement apparentées. Face à ce constat, l’usage de la 3D pour l’identification des espèces morphologiquement proches représente un atout. Observer les formes anatomiques sur des images 3D non texturées permet de s’affranchir de certains biais liés à la couleur, à l’altération de la surface des os archéologiques, et d’accéder à une lecture plus fine de la morphologie, voire d’observer des critères anatomiques non documentés. En ce sens, il devient possible de questionner la diversité des populations animales entre les espèces mais aussi au sein des espèces : existe-t-il des variétés morphologiques différentes selon les périodes ? Les populations de caprinés ou de cervidés se sont-elles adaptées face aux contraintes anthropiques/environnementales durant l’Holocène ?
L’objectif de ce mémoire de Master 1 est d’apprendre les bases de l’ostéologie et de l’anatomie comparée, méthodes fondamentales de l’archéozoologie, à partir de l’acquisition et du traitement 3D des données ostéologiques. Ce travail sera réalisé à partir des collections ostéologiques modernes disponibles au sein du laboratoire du CEPAM, en particulier les caprinés (mouton, chèvre, chamois…) et les cervidés (chevreuil, cerf…). Le travail attendu se décline en plusieurs volets :
- Initiation à l’anatomie des herbivores (caprinés, cervidés) à partir des collections physiques, des manuels d’ostéologie et d’une sélection fournie de publications
- Initiation à l’acquisition 3D des ossements
- Description des ossements 3D à partir des manuels d’anatomie et des observations réalisées directement sur les modèles 3D
- Initiation à la structuration des données 3D en vue de leur exploitation
- Intégration des modèles 3D dans la base de données « Apozoothèque » du CEPAM
En cas de poursuite du mémoire en Master 2, l’étudiant.e approfondira ses connaissances en anatomie comparée et en imagerie 3D. Il/elle réalisera une étude archéozoologique complète, numérisera et décrira morphologiquement les ossements 3D d’intérêts. Côté gestion de données, il/elle apprendra à définir ce qu’est une donnée FAIR et à appliquer ces principes à ses propres données. Il/elle sera initié.e à l’interopérabilité sémantique (usage des standards Darwin Core/consortium 3D), ainsi qu’aux bonnes pratiques de préparation et de structuration des données (par exemple dans Excel) pour les rendre propres, utilisables avec d’autres outils, réutilisables par d’autres et pérennes.
Compétences souhaitables :
- Motivation pour l’apprentissage de l’anatomie comparée et de l’archéozoologie
- Connaissance des données de la biodiversité animale
- Intérêt nécessaire pour l’acquisition, la visualisation et l’analyse des données tridimensionnelles (débutant possible)
- Appétence pour les bases de données et l’open science
- Esprit d’initiative et goût pour le travail, à la fois en équipe, et en autonomie
